• ¡Welcome to Square Theme!
  • This news are in header template.
  • Please ignore this message.
Здравейте гост! Вход Регистрация


Рейтинг:
  • 0 Гласа - 0 Средно
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
Genome diversity in Ukraine
#1
Излязло е ново изследване за украинците на база пълен геном. Тествани са 97 украинци от Украйна, като се избрани по цялата територия, за пълен геном с покритие 30Х в компанията BGI, Китай(където някои европейски компании също си пращат тестовете).
Резултатите са сканирани предимно за медицински мутации, но има и PCA плот за произход. Той не дава нищо ново, но изглежда пак се изхитрят да изберат руски семпъли от Северна Русия(използвани са само Russia_HGDP пробите от Вологда) и да се изкарат по-далеч от руснаците, отколкото до германците. Иначе Russia Cossacks се припокриват с тях и са долу-горе идентични с някои от поляците.
Тъй като резултатите са с открит достъп, сигурно YFULL ще качи на дървото хаплогрупите, които не се споменават тука.

https://academic.oup.com/gigascience/art...59/6079618

Abstract
Background
The main goal of this collaborative effort is to provide genome-wide data for the previously underrepresented population in Eastern Europe, and to provide cross-validation of the data from genome sequences and genotypes of the same individuals acquired by different technologies. We collected 97 genome-grade DNA samples from consented individuals representing major regions of Ukraine that were consented for public data release. BGISEQ-500 sequence data and genotypes by an Illumina GWAS chip were cross-validated on multiple samples and additionally referenced to 1 sample that has been resequenced by Illumina NovaSeq6000 S4 at high coverage.

Results
The genome data have been searched for genomic variation represented in this population, and a number of variants have been reported: large structural variants, indels, copy number variations, single-nucletide polymorphisms, and microsatellites. To our knowledge, this study provides the largest to-date survey of genetic variation in Ukraine, creating a public reference resource aiming to provide data for medical research in a large understudied population.

Conclusions
Our results indicate that the genetic diversity of the Ukrainian population is uniquely shaped by evolutionary and demographic forces and cannot be ignored in future genetic and biomedical studies. These data will contribute a wealth of new information bringing forth a wealth of novel, endemic and medically related alleles.



[Снимка: giaa159fig2.jpeg?Expires=1613638938&Sign...RDK6RD3PGA]
МтДнк: Т2
 
Reply
#2
(01-14-2021, 12:24 PM)genefan Писа: Излязло е ново изследване за украинците на база пълен геном. Тествани са 97 украинци от Украйна, като се избрани по цялата територия, за пълен геном с покритие 30Х в компанията BGI, Китай(където някои европейски компании също си пращат тестовете).
Резултатите са сканирани предимно за медицински мутации, но има и PCA плот за произход. Той не дава нищо ново, но изглежда пак се изхитрят да изберат руски семпъли от Северна Русия(използвани са само Russia_HGDP пробите от Вологда) и да се изкарат по-далеч от руснаците, отколкото до германците. Иначе Russia Cossacks се припокриват с тях и са долу-горе идентични с някои от поляците.
Тъй като резултатите са с открит достъп, сигурно YFULL ще качи на дървото хаплогрупите, които не се споменават тука.

https://academic.oup.com/gigascience/art...59/6079618

Abstract
Background
The main goal of this collaborative effort is to provide genome-wide data for the previously underrepresented population in Eastern Europe, and to provide cross-validation of the data from genome sequences and genotypes of the same individuals acquired by different technologies. We collected 97 genome-grade DNA samples from consented individuals representing major regions of Ukraine that were consented for public data release. BGISEQ-500 sequence data and genotypes by an Illumina GWAS chip were cross-validated on multiple samples and additionally referenced to 1 sample that has been resequenced by Illumina NovaSeq6000 S4 at high coverage.

Results
The genome data have been searched for genomic variation represented in this population, and a number of variants have been reported: large structural variants, indels, copy number variations, single-nucletide polymorphisms, and microsatellites. To our knowledge, this study provides the largest to-date survey of genetic variation in Ukraine, creating a public reference resource aiming to provide data for medical research in a large understudied population.

Conclusions
Our results indicate that the genetic diversity of the Ukrainian population is uniquely shaped by evolutionary and demographic forces and cannot be ignored in future genetic and biomedical studies. These data will contribute a wealth of new information bringing forth a wealth of novel, endemic and medically related alleles.



[Снимка: giaa159fig2.jpeg?Expires=1613638938&Sign...RDK6RD3PGA]

Това с Украинците е абсолютно същата работа като с нашите Македонци Киевска Рус била Украйна пък Русините от Карпатите не били Русини както те си се наричат а Украинци та така и с това много ясно че ще използват нарочно хора от Северна Русия за които се знае че са мешани с местните Фински племена както и в източна Финландия се усеща Славянско влияние вместо от Централна Русия които ще им излезнат близко население може би даже по-близко от някои части на Беларус понеже там има мешане със Западни Славяни и Балтийски племена.
 
Reply
#3
Какви са %?
EU-100
J-CTS6061
H2a2a1
 
Reply
#4
Един от изследваните се появи в Уфул на подклон на I-Z17855
EG600088 Zakarpatska oblast, Mukachevo
А тук в един форум обсъждат пробите:
http://www.balto-slavica.org/forum/index...453&page=2


Прикачени файла Малки снимки
   
 
Reply
#5
Ето и всички проби качени в Уфул:


Прикачени файла Малки снимки
   
 
Reply
#6
(02-05-2021, 05:04 AM)Радка Симеонова Писа: Ето и всички проби качени в Уфул:
Голямо разнообразие на I и R.
EU-92
R-YP617*(341019,YF02433)
E-V13-BY4523(364883, YF05703)
R1a-Z93-Y15121-Y5271*(364878, YF06450)
J2a-M67-PH2758(366674, YSEQ2606)
J2a-L25-PF5350*(364879, YSEQ2347)
E-V13-FGC11450*(407620,YSEQ3598)
I2a-Y3548*(366675, YF07848)
I2a-Y3548*(414297, YF07821)
U4c1a
 
Reply
#7
Много ти благодаря, доста интересно Smile
EU-100
J-CTS6061
H2a2a1
 
Reply
#8
На форум Балтославика някой е усреднил всички украински геноми и ги е сравнил с други населения. Българите са извън класацията, а от балканските народи са по-близки с тези с повече "славянско" като хърватите. Да си помислят тези, които развиваха теории, че прабългарите били измесени с украински славяни.

Също се развенчава хипотезата, че задкарпатските украинци са езиково славянизирани власи, пак са най-близо до хърватите.


Прикачени файла Малки снимки
       
МтДнк: Т2
 
Reply
#9
Ми те и хърватите си имат така нареченото влашко
EU-100
J-CTS6061
H2a2a1
 
Reply
#10
(02-05-2021, 02:29 PM)Yaan Писа: Ми те и хърватите си имат така нареченото влашко

Само тези от Далмация, там си има от армъните.
МтДнк: Т2
 
Reply
  


Към форум: