• ¡Welcome to Square Theme!
  • This news are in header template.
  • Please ignore this message.
Здравейте гост! Вход Регистрация


Рейтинг:
  • 10 Гласа - 2.7 Средно
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
The genetic history of Ice Age Europe
#11
Таблицата с резултатите е оплескана. Например Pavlov1 е даден като C1a2, а в допълнителния PDF файл към статията е даден като I. По същия начин Vestonice16 е даден като IJK в таблицата, а в допълнителния файл като C1a2. Ето резултатите след моя анализ на данните:

Код:
Sample            Reported Hg    My Hg
BerryAuBac      I               I
Burkhardtshohle I               I
Chaudardes1     I               I
Cioclovina1     CT              CT
Falkenstein     F               F (or G, or I2a2a1)
GoyetQ-2        HIJK            I
GoyetQ116-1     C1a             C1a2
HohleFels49     I               I
Kostenki12      CT              C
Kostenki14      C1b             C1b
Paglicci133     I               I
Pavlov1         C1a2/I          I
Rochedane       I               I (or I2)
Vestonice13     CT(xIJK)        C
Vestonice15     BT              A0-T
Vestonice16     IJK/C1a2        C1a2
Vestonice43     F               F (or IJ)
Villabruna      R1b1            R1b1a
mtDNA: T2f2
Y-DNA: R1b1a1a2a2c1a1a3 (A1777/BY611/Y10789)
 
Reply
#12
Всъщност семпъл Kostenki12 може да не е CT, а да е BT. Сниповете на ниво CT са пълно мазало. Преди два месеца с Рей Бенкс оправихме BT, но съм пропуснал CT, защото CT си няма собствена хаплогрупна страница и не съм погледнал страницата на основното дърво.
mtDNA: T2f2
Y-DNA: R1b1a1a2a2c1a1a3 (A1777/BY611/Y10789)
 
Reply
#13
Мен ме интересува женската група R1b, която е намерена в Афонтова гора в кости отпреди 16000 години. Както знаете, тази група е много рядка в Европа, има само няколко семпъли в Генбанк, един от които е на моя позната българка от Сидни. Тази хаплогрупа бе намерена и при неолитчици от Унгария. Това изглевда е същата R3 по-надолу, това е по старата нпменклатура, още една бърканица в таблицата.
Трифуд, може ли да ми кажеш точните мутации, защото нямам достъп до Supplementary files.
МтДнк: Т2
 
Reply
#14
(05-10-2016, 04:05 PM)genefan Писа: Мен ме интересува женската група R1b, която е намерена в Афонтова гора в кости отпреди 16000 години. Както знаете, тази група е много рядка в Европа, има само няколко семпъли в Генбанк, един от които е на моя позната българка от Сидни. Тази хаплогрупа бе намерена и при неолитчици от Унгария. Това изглевда е същата R3 по-надолу, това е по старата нпменклатура, още една бърканица в таблицата.
Трифуд, може ли да ми кажеш точните мутации, защото нямам достъп до Supplementary files.

Хвана ме неподготвен. Към момента нямам методология за извличане на mtDNA секвенции от BAM файлове в удобен формат. Още повече, че тук трябва да се работи не с hg19, а с референтния геном на Кембридж. Мога да погледна през уикенда ако имам време. Иначе не е проблем да погледна в BAM файла ако те интересуват определени мутации.
mtDNA: T2f2
Y-DNA: R1b1a1a2a2c1a1a3 (A1777/BY611/Y10789)
 
Reply
#15
Моля, провери от мутациите тук дали става въпрос само за R1b, намерени в Северна Якутия, или за R1b1, каквато е българката.

http://www.ianlogan.co.uk/sequences_by_g...uences.htm
МтДнк: Т2
 
Reply
#16
Този семпъл има пълно покритие на митохондриалната ДНК. Ето съпоставено с мутациите на KP702821(Bulgaria) FTDNA:

SNP AfontovaGora3
A73G +
C150T +
A241G +
A263G +
309.1C +
315.1C +
A515G -
523.1C +
523.2A +
523.3C +
523.4A +
A750G +
T1095C +
T1391C +
A1438G +
A2706G +
T3394C +
A4769G +
A5855G -
C6683T -
C7028T +
G7805A -
A8860G -
C11122A -
C11151T +
A11224G -
G11719A +
T11809C -
T12245C +
A12358G -
G12406A -
A13167G +
G13359A +
C14239T +
C14766T +
A15326G +
G15884A -
T15940C +
T16311C +
T16519C +
mtDNA: T2f2
Y-DNA: R1b1a1a2a2c1a1a3 (A1777/BY611/Y10789)
 
Reply
#17
(05-11-2016, 10:07 PM)Trifud Писа: Този семпъл има пълно покритие на митохондриалната ДНК. Ето съпоставено с мутациите на KP702821(Bulgaria) FTDNA:

SNP AfontovaGora3
A73G +
C150T +
A241G +
A263G +
309.1C +
315.1C +
A515G -
523.1C +
523.2A +
523.3C +
523.4A +
A750G +
T1095C +
T1391C +
A1438G +
A2706G +
T3394C +
A4769G +
A5855G -
C6683T -
C7028T +
G7805A -
A8860G -
C11122A -
C11151T +
A11224G -
G11719A +
T11809C -
T12245C +
A12358G -
G12406A -
A13167G +
G13359A +
C14239T +
C14766T +
A15326G +
G15884A -
T15940C +
T16311C +
T16519C +

Дефиниращите мутации за R1b1 са  G513A C6683T C11122A, които липсват В Афонтова гора, но същевременно тя има T3394C, която минава за частна мутация при българката. По този начин е по-близка до якутските семпъли, което е обяснимо, защото костите са изкопани около Красноярск, Южен Сибир. Якутите се разселват на север едва в последните няколостотин години.
МтДнк: Т2
 
Reply
#18
(05-03-2016, 09:37 PM)Trifud Писа: Значи от това изследване се потвърди, че Aurignacian действително са първите европейци, на които ние сме наследници.

Още от предишното изследване, което излезе наскоро, се потвърди, че мезолитното население има доста малко общо с предишното палеолитно. Вероятно всички или почти всички европейци са измрери през Късния Дриас. Тогава точно в период на затопляне и завършек на Ледената епоха, изведнъж необяснимо има такова рязко и бързо застудяване, че месото от мамутите които изкопават из Сибир е напълно годно за консумация, не знам някой от тези които са го пробвали да са се оплакал. Има различни предположения за причината на това събитие (мегавулкан, метеорит, изместване на земната ос), но то е рязко и с голяма сила и е един от основните кандидати за изчезването на мегафауната в голяма част от света. Същото събитие докарва голяма суша в Плодородния полумесец и е една от предполагаемите причини за преминаване към уседналост и земеделие.

(05-03-2016, 09:37 PM)Trifud Писа: Интересното е, че Aurignacian са носили мъжка хаплогрупа C. Но преди около 33 000 години в Европа влизат други хора и маргинализират Aurignacian, чиито потомци се разпростират из цяла Европа отново преди 19 000 години. Може би тази нова група хора са носили хаплогрупа I? Такъв е например един семпъл от Италия на 34 000 години.

Каквито и групи да са имали, тези хора са мигрирали или измрели и (напълно или в по-голямата си част) не са предци на днешните европейци. Приеми ги като починал вуйчо без наследници. Както виждаш имаме I и C-V20 сред анатолийските мезолитчици, което ясно показва какви групи е имало сред техните мезолитни предци и сред тези от Плодородния полумесец.

За сега (преди тестване на Втората неолитна вълна по мъжка линия) изглежда, че и първите неолитчици не са допринесли много за сегашния генофонд, при това и по мъжка и по женска линия. Но по женска линия неолитчиците от втората вълна и енеолитчиците вече приличат на нас. Дори всички балкански енеолитчици да са били изтрепани като кучета от озверялата степна гмеж, както смятат гимбусоидите (аз не смятам така), пак не е проблем анатолийско население да навлезе тук през Бронза и Желязото.

А един R1b в палеолитна Италия пролет не прави. Имаме реликтови клони на R1a (M198-) и J1 (близо до корена) от мезолита на днешна Русия и наследниците на тези двамата или не са доживели до днес, или са много малко.

Все повече се доказва теорията, че западняшките R1b-L11 навлизат в Европа от Африка, примерно от тези предшественици. И сега в Северна Африка има много от типичните за западняците женски групи H1 и V, разбира се това са достатъчно стари групи, за да не се срещат само там и някои линии да са навлезли от изток.
J2b1-M205
 
Reply
#19
Изследването показва, че има континуитет между всички проби от оринаковата култура до неолита (и до днес). За друго не знам.

Относно R1b, имаме една R1b1  проба и от Испания на 7000 години от това изследване: http://www.nature.com/nature/journal/v52...14317.html Но тази от Италия е с около 2000 години по-стара. Така че може и да не е случайно.
mtDNA: T2f2
Y-DNA: R1b1a1a2a2c1a1a3 (A1777/BY611/Y10789)
 
Reply
#20
(05-12-2016, 10:29 PM)Trifud Писа: Изследването показва, че има континуитет между всички проби от оринаковата култура до неолита (и до днес). За друго не знам.

Както вече писах, не можем да сме синове на починалия си бездетен вуйчо. Дори той да е същата хаплогрупа като нас и автосомно да е почти като нас. Разбира се "гените" му живеят и до днес, понеже заедно с майка ни (или баща ни), те споделят общи родители.

Точно по същите причини ямненците (Z2103), макар да споделят голямо количество автосомни компоненти с шнуроваците (R1b-U106, R1a-Z284, R1a-L644) и Синташа/Андроново/Срубна (Z93), не са техни родители, а братовчеди с общ източник на въпросните компоненти нейде из Азия, част от тях ги имаме още при момчето от М'алта преди има-няма 24 000 години. Още по-малко ямненците имат нещо общо с произхода на западните L11+.

Същата картинка я имаме и днес - макар южноевропейците помежду си да са доста близки, както и северняците помежду тях, това не означава, че българите произхождат от италианците или обратно, а че в течение на хилядолетия са оформяни от различни групи хора, носители на общи компоненти.

(05-12-2016, 10:29 PM)Trifud Писа: Относно R1b, имаме една R1b1  проба и от Испания на 7000 години от това изследване: http://www.nature.com/nature/journal/v52...14317.html Но тази от Италия е с около 2000 години по-стара. Така че може и да не е случайно.

И руските мезолитни R1a и J1 са от 5500-5000 ВС ...

Отделно за "испанеца", той има:  Big Grin

M415+, M343+, [L754 equivalent: L774/PF6245/YSC277+, PF1144+, V88 eqivalent: PF6376+], M478-, PF6399-, L265-, L150-, M269-, V35-, V69-
J2b1-M205
 
Reply
  


Към форум: