• ¡Welcome to Square Theme!
  • This news are in header template.
  • Please ignore this message.
Здравейте гост! Вход Регистрация


Рейтинг:
  • 0 Гласа - 0 Средно
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
Връзка между средновековна испанка и европейско население по IBD
#1
Излязло е ново изследване на испански генетици, които са сравнили генома на жена от средновековно испанско гробище 14 век със съвременно население на Европа. Не е за учудване, че са намерили най-много общо блокове между нея и други испанци.
Според тях сравнение с древни индивиди относно произхода на съвременно население трябва да се прави не само по метода на PCA, Admixture и пр, но и анализ на IBD(Identity by descent). Това ще позволи да се определи по-точно произхода от по-старо население и генетичната връзка между различни народности.
Интересното за нас тук е, че са включили в анализа и 10 българи (повечето народности участват с малък брой индивиди). Има няколко графики и малко странното е, че при българите са открили само 3 двойки, които споделят блокове над 6СМ - един българин/българин, един българин/албанец и един българин испанец!?
На фигура 5 се вижда и мрежата на връзки в Югоизточна Европа. Албанците и гърците образуват някакъв кластер, за който е вързан и един българин. Румънците са по-далече, но също косвено са свързани с гърци, а не българи.

https://www.nature.com/articles/s41598-020-64007-2
Mapping co-ancestry connections between the genome of a Medieval individual and modern Europeans


Abstract
Historical genetic links among similar populations can be difficult to establish. Identity by descent (IBD) analyses find genomic blocks that represent direct genealogical relationships among individuals. However, this method has rarely been applied to ancient genomes because IBD stretches are progressively fragmented by recombination and thus not recognizable after few tens of generations. To explore such genealogical relationships, we estimated long IBD blocks among modern Europeans, generating networks to uncover the genetic structures. We found that Basques, Sardinians, Icelanders and Orcadians form, each of them, highly intraconnected sub-clusters in a European network, indicating dense genealogical links within small, isolated populations. We also exposed individual genealogical links -such as the connection between one Basque and one Icelandic individual- that cannot be uncovered with other, widely used population genetics methods such as PCA or ADMIXTURE. Moreover, using ancient DNA technology we sequenced a Late Medieval individual (Barcelona, Spain) to high genomic coverage and identified IBD blocks shared between her and modern Europeans. The Medieval IBD blocks are statistically overrepresented only in modern Spaniards, which is the geographically closest population. This approach can be used to produce a fine-scale reflection of shared ancestry across different populations of the world, offering a direct genetic link from the past to the present.


[Снимка: 41598_2020_64007_Fig1_HTML.png?as=webp]

[Снимка: 41598_2020_64007_Fig5_HTML.png?as=webp]
МтДнк: Т2
 
Reply
#2
(04-26-2020, 01:33 PM)genefan Писа: Излязло е ново изследване на испански генетици, които са сравнили генома на жена от средновековно испанско гробище 14 век със съвременно население на Европа. Не е за учудване, че са намерили най-много общо блокове между нея и други испанци.
Според тях сравнение с древни индивиди относно произхода на съвременно население трябва да се прави не само по метода на PCA, Admixture и пр, но и анализ на IBD(Identity by descent). Това ще позволи да се определи по-точно произхода от по-старо население и генетичната връзка между различни народности.
Интересното за нас тук е, че са включили в анализа и 10 българи (повечето народности участват с малък брой индивиди). Има няколко графики и малко странното е, че при българите са открили само 3 двойки, които споделят блокове над 6СМ - един българин/българин, един българин/албанец и един българин испанец!?
На фигура 5 се вижда и мрежата на връзки в Югоизточна Европа. Албанците и гърците образуват някакъв кластер, за който е вързан и един българин. Румънците са по-далече, но също косвено са свързани с гърци, а не българи.

https://www.nature.com/articles/s41598-020-64007-2
Mapping co-ancestry connections between the genome of a Medieval individual and modern Europeans


Abstract
Historical genetic links among similar populations can be difficult to establish. Identity by descent (IBD) analyses find genomic blocks that represent direct genealogical relationships among individuals. However, this method has rarely been applied to ancient genomes because IBD stretches are progressively fragmented by recombination and thus not recognizable after few tens of generations. To explore such genealogical relationships, we estimated long IBD blocks among modern Europeans, generating networks to uncover the genetic structures. We found that Basques, Sardinians, Icelanders and Orcadians form, each of them, highly intraconnected sub-clusters in a European network, indicating dense genealogical links within small, isolated populations. We also exposed individual genealogical links -such as the connection between one Basque and one Icelandic individual- that cannot be uncovered with other, widely used population genetics methods such as PCA or ADMIXTURE. Moreover, using ancient DNA technology we sequenced a Late Medieval individual (Barcelona, Spain) to high genomic coverage and identified IBD blocks shared between her and modern Europeans. The Medieval IBD blocks are statistically overrepresented only in modern Spaniards, which is the geographically closest population. This approach can be used to produce a fine-scale reflection of shared ancestry across different populations of the world, offering a direct genetic link from the past to the present.


[Снимка: 41598_2020_64007_Fig1_HTML.png?as=webp]

[Снимка: 41598_2020_64007_Fig5_HTML.png?as=webp]
Съвременното разнообразие пряко корелира с ансестралното разнообразие. Източните Балкани, разбирай всичко на изток от реките Морава и Вардар, тоест българският етнически хинтерланд-Сегашната политическа територия на България, източна Сърбия и голяма част от Северна Македония плюс северна Гърция без района на Солун и Халкидики на юг от езерата, са изключително разнообразни в генетично отношение, което поставя две възможности-тук са корените на целия свят, с което твърдение спекулират официалните български генетици и пишман генетиците от средите на автохтонците тракедонисти. Другата възможност е тук да е розата на ветровете, транзитната зона на Европа, мястото където се пресичат пътищата на всички мигранти от 4 континента от времето на неолита, та досега. Това е разликата със всичките ни политически съседи-румънци, сърби, гърци и албанци, които всъшност маркират посоките на входяща миграция. Нормално е при тях блоковете на водещите ансестрални компионенти да са по-големи от тези в България. Нормално е при тях да има и десцендни групирания и това се вижда особено на дървото на Yfull, на база пълни секвенси, че всички наоколу при еквивалентни на българските брой тестове в комерческите компании правят отчетливи албански, сръбски, румънски и гръцки клонове и клончета, докато българите правят клончета не помежду си, а с околните, а и с такива от западни Балкани. Факт е, че българите сме преживели два отчетливи политико биологични геноциди за 400 години в късно Средновековие, когато двукратно по причини чуждо нашествие, вътрешни междуособици, липса на държавност, чумни, а и други епидемии българската популация в горните граници е свеждана от 3 милиона до около 1 милион. Сегашните българи сме потомци на оцелелите от последния геноцид от преди 200-250 години. Което се отразява на липсата на общи сегментни в ансестрално и десцендно отношение, както и липса на отчетливи български клонове по отношение на Y хромозомата.
EU-92
R-YP617*(341019,YF02433)
E-V13-BY4523(364883, YF05703)
R1a-Z93-Y15121-Y5271*(364878, YF06450)
J2a-M67-PH2758(366674, YSEQ2606)
J2a-L25-PF5350*(364879, YSEQ2347)
E-V13-FGC11450*(407620,YSEQ3598)
I2a-Y3548*(366675, YF07848)
I2a-Y3548*(414297, YF07821)
U4c1a
 
Reply
#3
ДА, така е, оцелели са отделни клонки, но по начало сме били различни. Това се отбелязва и в статията - населението на Южна Европа е често по-близко с други народности, отколкото един до друг. Но при албанците като че всички са много близо помежду си, явно произлизат само от едно малко племе, също едва оцеляло по Средновековието. Но те са имали предимството да се ислямизират и така да вземат господстващо положение в Югозападните Балкани, което се отразява и на демографския им бум в последно време. Тъй като българите, поне в Източна България са преселници от различни места, те не са имали време да се сродят и да споделят по-големи блокове. Докато при Балканджиите, които изглежда са живели изолирани по-дълго време, има доста чувствителен Ашкеназки ефект - повечето излизат някакви аутозомни роднини, има кластеризация при мъжките хаплогрупи и пр.
МтДнк: Т2
 
Reply
#4
(04-27-2020, 02:47 PM)genefan Писа: ...албанците като че всички са много близо помежду си, явно произлизат само от едно малко племе, също едва оцеляло по Средновековието. Но те са имали предимството да се ислямизират и така да вземат господстващо положение в Югозападните Балкани, което се отразява и на демографския им бум в последно време....

...албанците като че всички са много близо помежду си, явно произлизат само от едно малко племе, също едва оцеляло по Средновековието. Но ислямизирането на голяма част от тях им е дало предимството да заемат господстващо положение в Югозападните Балкани, което се отразява и на демографския им бум в последно време....

Лека смислова редакция.
 
Reply
#5
Да, но пък тези албанци, които не се ислямизират сега са в повечето гърци, италианци, македонци и пр.
То и голяма част от които само преди 200г. са били българи сега са македонци, гърци, турци и т.н.
МтДнк: Т2
 
Reply
  


Към форум: