• ¡Welcome to Square Theme!
  • This news are in header template.
  • Please ignore this message.
Здравейте гост! Вход Регистрация


Рейтинг:
  • 0 Гласа - 0 Средно
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
Ancient Rome: A genetic crossroads of Europe and the Mediterranean
#1
Излязла е в Nature дългоочакваната статия за Древен Рим. Всъщност са събрани 127 древни генома от Палеолита до Средновековието от района на град Рим, за да се разбере по-ясно как се е променяла популацията с разните миграции.

https://sci-hub.tw/10.1126/science.aay6826

Ancient Rome was the capital of an empire of ~70 million inhabitants, but little is known about the genetics of ancient Romans. Here we present 127 genomes from 29 archaeological sites in and around Rome, spanning the past 12,000 years. We observe two major prehistoric ancestry transitions: one with the introduction of farming and another prior to the Iron Age. By the founding of Rome, the genetic composition of the region approximated that of modern Mediterranean populations. During the Imperial period, Rome’s population received net immigration from the Near East, followed by an increase in genetic contributions from Europe. These ancestry shifts mirrored the geopolitical affiliations of Rome and were accompanied by marked interindividual diversity, reflecting gene flow from across the Mediterranean, Europe, and North Africa.

Similar to early farmers from other parts of Europe, Neolithic individuals from central Italy project near Anatolian farmers in PCA (13, 14, 17–19) (Fig. 2A). However, ADMIXTURE reveals that, in addition to ancestry from northwestern Anatolia farmers, all of the Neolithic individuals that we studied carry a small amount of another component that is found at high levels in Neolithic Iranian farmers and Caucasus hunter-gatherers (CHG) (Fig. 2B and fig. S9). This contrasts with contemporaneous central European and Iberian populations who carry farmer ancestry predominantly from northwestern Anatolia (fig. S12). Furthermore, qpAdm modeling suggests that Neolithic Italian farmers can be modeled as a two-way mixture of ~5% local hunter-gatherer ancestry and ~95% ancestry of Neolithic farmers from central Anatolia or northern Greece (table S7), who also carry additional CHG (or Neolithic Iranian) ancestry (fig. S12) (14). These findings point to different or additional source populations involved in the Neolithic transition in Italy compared to central and western Europe.

The Iron Age individuals exhibit highly variable ancestries, hinting at multiple sources of migration into the region during this period (Figs. 2A and 3B). Although we were able to model eight of the 11 individuals as two-way mixtures of Copper Age central Italians and a Steppe-related population (~24 to 38%) using qpAdm, this model was rejected for the other three individuals (p < 0.001; table S16). Instead, two individuals from Latin sites (R437 and R850) can be modeled as a mixture between local people and an ancient Near Eastern population (best approximated by Bronze Age Armenian or Iron Age Anatolian; tables S17 and S18). An Etruscan individual (R475) carries significant African ancestry identified by f-statistics (|Z-score|>3; fig. S23) and can be modeled with ~53% ancestry from Late Neolithic Moroccan (table S19). Together these results suggest substantial genetic heterogeneity within the Etruscan (n = 3 individuals) and Latin (n = 6) groups. However, using f-statistics, we did not find significant genetic differentiation between the Etruscans and Latins in allele sharing with any preceding or contemporaneous population (|Z-score|<2), although the power to detect subtle genetic differentiation is limited by the small sample size.
 

Отивам да чета по форумите какви хаплогрупи са открити.
МтДнк: Т2
 
Reply
#2
Sample information, Y and mtDNA:
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1...sp=sharing

A 10,000-year transect of Roman populations
Rome wasn't built (or settled) in a day. Antonio et al. performed an ancestral DNA analysis to investigate the genetic changes that occurred in Rome and central Italy from the Mesolithic into modern times. By examining 127 Roman genomes and their archaeological context, the authors demonstrate a major ancestry shift in the Neolithic between hunter gatherers and farmers. A second ancestry shift is observed in the Bronze Age, likely coinciding with trade and an increased movement of populations. Genetic changes track the historical changes occurring in Rome and reflect gene flow from across the Mediterranean, Europe, and North Africa over time.
https://science.sciencemag.org/content/366/6466/708

The raw data will be here, when it comes out shortly:
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32566
 
Reply
#3
Изглежда не е имало аутозомна разлика между етруските и населението от железния век в областта Лациум около Рим. Така се предполага местен произход на етруските, а не миграции от Анадола или Балканите.
Населението нa Ранния Републикански Рим е сравнително европейско, вероятно има наплив от север през Бронза и и Железния век с по-силно степно влияние, също доминира хаплогрупа R1b-Р312. През имперския период, обаче, има силно изместване на плота към Източното Средиземноморие и Близкия Изток и почват да доминират хаплогрупи J1 и J2. Прави впечатление също, че хаплогрупа E-V13, която сега е доста разпространена в Италия, се появява за пръв път в пробите едва в Късната Античност и Средновековието.
МтДнк: Т2
 
Reply
#4
По форумите се коментира, че напливът на ново население през Имперския период е основно от Магна Греция - т.е от елинизираното население на Южна Италия, плюс елинистичните държави на Балканите, Анадола и Близкия Изток. Това може да служи за индикация и какви са били Древните Елини. По всичко изглежда те не са били чисто европейски, а по-скоро източносредиземноморски народ. Пеобладаващите хаплогрупи са били J1 и J2, с по-малко T и G. Абсолютно липсва през всички периоди на Рим и хаплогрупа R1a и I2a Dinaric. Мезолитната I2 е I2a-L161 Isles, която е много разпространена в Европа през този период. По-нататък се среща само старата I2b1, сега I2a-M223. Прави впечатление и пълната липса на R1b-Z2103, твърде вероятно е да идва в Италия едва с анадоло-византийци в Ранното Средновековие.
По-следващото североевропейско, което променя генома на италийците около Рим също се идентифицира по-скоро като западноевропейско(иберо-френско-английско) отколкото като средноевропейско(германско). Някои смятат, че това се дължи на евакуацията на цивилизованата върхушка в Британия, Галия и Иберия към Рим след напускане на римските войски от съответните провинции. По-богатите римляни пък може да са се изнесли към Византия след пълния упадък на града Рим и Италия след варварските нашествия.
МтДнк: Т2
 
Reply
#5
Тъй като .bam файловете от изследването са вече публикувани, ентусиастите се втурнаха да определят по-дълбоко хаплогрупите. За съжаление, не намирам никъде систематизирани резултати.
Това е което се върти по форумите.
Алф е обработил двата E-V13, един е L241, но от клонове, срещани в Западна Европа, а другия стига само до CTS5856.
R107 is V13>Z1057>CTS5856>Z5018>S2979>Z16659>L241>Z38770>Y19527
R1219 is V13>Z1057>CTS5856 at this point.

R53; 1280-1430 AD; Villa Magna; Medieval; E1b1b-L19>PF2431>Z21068>PF2438>Y10541>Y10561>pre-FGC19010 (3 derived, 8 ancestral SNPs)

Оказва се, че все пак има един R1a, но е от клона Z93. "So far I can track down 1 Black Sea Turk, 5 Balkars, 1 Brit. Will start doing a deep dive on other R-F1019's out there."
R1548, Monterotondo 27 BCE-300 CE (Imperial Rome), belongs to R1a-Z93>F1345>F1019 https://www.yfull.com/tree/R-F1019/

R19; 5345-5221 BC; Ripabianca di Monterado; Neolithic; J2a1a-M67>Z1847>Y4036>Z467>(pre-)S11842* (xZ6271,Y15913)
R17; 5324-5223 BC; Ripabianca di Monterado; Neolithic; J2a2-PF5008>L581>Z37823>PF5000>pre-Y29673
R115, Via Piasiello 0-200 CE (Imperial Rome), belongs to J2a-M92>Z515>PH672 https://www.yfull.com/tree/J-PH672/
R1551, Monterotondo 55-211 CE (Imperial Rome), belongs to J2a-Z7671>Z30677* https://www.yfull.com/tree/J-Z30677/
R68, ANAS 100-300 CE (Imperial Rome), belongs to J2a-F3133>Z7706>FGC9942* https://www.yfull.com/tree/J-FGC9942/
R117, San Ercolano 400-600 CE (Late Antiquity), belongs to J2a-M319* https://www.yfull.com/tree/J-M319/
R969, Tivoli Palazzo Cianti 1600-1700 CE (Renaissance), belongs to J2a-Y6240>PF7394* https://www.yfull.com/tree/J-PF7394/
R1221, Cancelleria 1480-1490 CE (Renaissance), belongs to J2a-L70>Z2177>PH185>FGC32147 https://www.yfull.com/tree/J-FGC32147/


R1547; 27 BC-300 AD; Monterotondo; Imperial Rome; J1a-Z2331>Z2324>Z2317>Z2313>YSC0000234>Z1884>Y2919>Y60 94 (xY6096,ZS1706,ZS5563)
R1549; 27 BC-300 AD; Monterotondo; Imperial Rome; J1a-Z2331>Y15152>ZS4336 (xZS4312,Y154827)
R130; 300-500 AD; Marcellino & Pietro; Late Antiquity; J1a-P58>Y4067>L817>pre-L818 (xL816)
R128; 0-400 AD; Casale del dolce ; Imperial Rome; J1a-Z1828>Z1842>Y4423 (xZS3042,BY100,CTS1460a,Y83506)
R105; 400-600 AD; Crypta Balbi; Late Antiquity; J1a-YSC0000234>Z1884>FGC12834>PF4876>L829 (xPF4878)



R9; 5607-5485 BC; Grotta Continenza; Neolithic; G2a2a-PF3147>PF3148>PF3177>L91>Z42565
R29; 3500-900 BC; Su Crocefissu; Sardinia LCA/EBA (Bonnanaro Culture); G2a2b-PF3359>F1193>PF3369>F872>PF3378
R4; 2950-2880 BC; Grotta Continenza; Chalcolithic; G2a2b-PF3359>F1193>PF3369>F872>F2572>F2214>pre-F807
R131; 0-200 AD; Via Paisiello, Necropoli Salaria; Imperial Rome; G2a2b-M406>M3317>FGC5089>FGC5081>L14*
R47; 232-333 AD; Centocelle; Imperial Rome; G2a2b-M406>M3317>PF3293>PF3316>Z6029>S9591
R132; 136-326 AD; Marcellino & Pietro; Imperial Rome; G2a2b-CTS342>Z724>Z1903>CTS7045>Z3408>Z3428>YP4752>Z6434
R1545; 1-400 AD; Mazzano Romano; Imperial Rome; G2a2b-U1>L13>Z2022>Z6759>pre-Z6764
R108; 400-600 AD; Crypta Balbi; Late Antiquity; G2a2b-L497>Z1815>Y7538>Z1816>Z1823>Z726>CTS4803>S2808
R1224; 1480-1490 AD; Cancelleria; Renaissance; G2a2b-L497>Z1815>Y7538>Z1816>Z1823>Z726>CTS4803>S2808>S2 3438>S18765

R33 (300 - 700 CE) is R-U152 > L2 > DF110:
R36 (400 - 600 CE) is R-U152 > Z56 > Z43/S366 > Z144 > Z29485
R31; 332-419 AD; Mausoleo di Augusto; Late Antiquity; R1b-P312>DF19>Z302>Z8193* (xCTS2975)
R1220 Renaissance period is R-DF27 > ZZ12 > BY21074 > Y81307


R66 (100-300 CE): R2a2-P267 (xR2a2a-FGC13203, xR2a2b2-Y23623, xR2a2b1-Y8763) - Either R2a2-P267* or R2a2b-Y12100*

R110; 400-600 AD; Crypta Balbi; Late Antiquity; I1-Z63>BY151>FGC81364>S2078>S2077>Y2245>Y7234
МтДнк: Т2
 
Reply
#6
Pretty much by looking at the Y lines and the designated autosomal cluster of Imperial Romans until Late Antiquity the corresponding Cultures match the Y dna

Italic

R1b-Z2118
R1b-L2>DF110
R1b-Z56>CTS6389
T-L131>Y6033 (pretty sure will belong to CTS54)

Celtic

G-L497>CTS4803
J2b-L283>Z631
R1b-DF19

Magna Graecia/Southern Italy (what probably came to Rome from Southern Italy)

G-M406>S9591
E-V12>PreBY8536
G-M406>L14*
J1-Y3081* (Probably Levant to Southern Italy)
J1-ZS4336 (Probably Levant to Southern Italy)
G-L140* (Neolithic survival?)
I-CTS616 (Neolithic survival?)
J2b-L283>Y23094*
E-V13>L241>Z38770*
J2a-M319
J2a-L70>PF5456>Z40772*
E-V12>Y21918

Levantine

J1-YSC76>Y6094
J2a-Y6240>Z6264

Greek (directly from Greece and Asia Minor)

J2a-Z6271
J2b-M205>Y13194 (Phoenician originally?)
J2a-SK1336
J2a-M92>Z515>PH672
R1b-Z2103
R1a-Z93>F1345>F1019 (Probably entered Turkey during MLBA)
J2a-L581*

Anatolia and Cyprus

R2a-Y3370
G-P303*
J2a-PH1222
J1-Y4423
J2a-Z7671>CTS900>Z30677
J1-PreL818
G-L13>Z6764 (Galatian?)

Mesopotamian

J2a-Y13534

Mixed

T-Y18004
G-Z6434
МтДнк: Т2
 
Reply
#7
Благодаря,колежки, много интересно! А В Сицилия толкова много ми хареса, както и в Неапол ще се радвам да имам връзка с Магна Греция Smile
EU-100
J-CTS6061
H2a2a1
 
Reply
#8
На anthrogenica един ентусиаст е направил карти, визуализиращи близостта на древните проби със съвременните популации .
Като изходни данни се вземат Global25 координатите на Давидски. (Цветовете са относителни - за всяка карта се изчисляват независимо)
Има за древен Рим, етруски, минойци, микенци, трак (BGR_IA:I5769), скити, гепиди, визиготи и т.н.
https://anthrogenica.com/showthread.php?...-Europeans
 
Reply
#9
BGR_IA е прословутата тракийка от Джюлюница, 500-400пр.н.е, сличайно попаднала в неолитните проби в изследването за Югоизточна Европа. Вижда се ясно, че е най-близо до гърци, албанци и южноиталианци. Тя си е върху сицилианците на плота, даден от самите учени, само Илиан и Стамов изглежда имат някакъв проблем със зрението и не го забелязват.
МтДнк: Т2
 
Reply
#10
(11-25-2019, 04:29 AM)genefan Писа: BGR_IA е прословутата тракийка от Джюлюница, 500-400пр.н.е, сличайно попаднала в неолитните проби в изследването за Югоизточна Европа. Вижда се ясно, че е най-близо до гърци, албанци и южноиталианци. Тя си е върху сицилианците на плота, даден от самите учени, само Илиан и Стамов изглежда имат някакъв проблем със зрението и не го забелязват.
Това, проблема със зрението на статистика и антрополога в психологията се нарича отхвърляне и е защитна реакция, което е нормално, така психиката се предпазва от шок. Когато защитната реакция продължи прекомерно дълго, то тогава става патология и човек започва да реагира с повод или без повод с дисоциативна слепота придружена с хистрионни реакции. За съжаление не само Йорданов и Стамов ги правят, а и Серафимов, Зиезито, Милчев, че даже и нашия Делев.
EU-92
R-YP617*(341019,YF02433)
E-V13-BY4523(364883, YF05703)
R1a-Z93-Y15121-Y5271*(364878, YF06450)
J2a-M67-PH2758(366674, YSEQ2606)
J2a-L25-PF5350*(364879, YSEQ2347)
E-V13-FGC11450*(407620,YSEQ3598)
I2a-Y3548*(366675, YF07848)
I2a-Y3548*(414297, YF07821)
U4c1a
 
Reply
  


Свързани теми...
Теми: Автор Отговори: Преглеждания: Последно мнение
  A 12,000-year Genetic History of Rome and the Italian Peninsula genefan 1 769 02-21-2019, 11:44 AM
Последно мнение: dilow

Към форум: