• ¡Welcome to Square Theme!
  • This news are in header template.
  • Please ignore this message.
Здравейте гост! Вход Регистрация


Рейтинг:
  • 14 Гласа - 2.71 Средно
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
Parallel paleogenomic transects reveal complex genetic history of early European farm
#1
127 нови проби (98 от Унгария, 42 от Германия и 37 от Испания) от Неолита и Халколита.

Ancient DNA studies have established that European Neolithic populations were descended from Anatolian migrants who received a limited amount of admixture from resident hunter-gatherers. Many open questions remain, however, about the spatial and temporal dynamics of population interactions and admixture during the Neolithic period. Using the highest-resolution genome-wide ancient DNA data set assembled to date --- a total of 177 samples, 127 newly reported here, from the Neolithic and Chalcolithic of Hungary (6000-2900 BCE, n = 98), Germany (5500-3000 BCE, n = 42), and Spain (5500-2200 BCE, n = 37) --- we investigate the population dynamics of Neolithization across Europe. We find that genetic diversity was shaped predominantly by local processes, with varied sources and proportions of hunter-gatherer ancestry among the three regions and through time. Admixture between groups with different ancestry profiles was pervasive and resulted in observable population transformation across almost all cultural transitions. Our results shed new light on the ways that gene flow reshaped European populations throughout the Neolithic period and demonstrate the potential of time-series-based sampling and modeling approaches to elucidate multiple dimensions of historical population interactions.

https://www.biorxiv.org/content/early/2017/11/01/114488

Enjoy!

Суровите данни още не са достъпни за да ги анализирам собственоръчно.
mtDNA: T2f2
Y-DNA: R1b1a1a2a2c1a1a3 (A1777/BY611/Y10789)
 
Reply
#2
Интересно, че още от неолита из цяла Европа има доста I2a2(бившо I2b). Така това не е донесено или разраснало се през Бронза. За съжаление,  повечето I2 е дадено само до I2a1, така не е ясно дали това е Сардинския, или Динарски вариант. Има само един от Унгария 3600-2850ВС, който е ясен I2a1a1, или Сардинец. Така кога се разрастват Динарците остава загадка.
Дано любителите намерят повече снипове.
МтДнк: Т2
 
Reply
#3
ха, ха-според Yful кога се разрастват динарците си е съвсем ясно-мутацията се появява в края на Неолита, най-вероятно в централна Европа и след като се разделя на два клона вегетира бавно и мъчително и през бронза и през желязото. В края на римската епоха единия клон започва бурно разрастване, което се свързва със славянските нашествия и славянизацията на половин Европа, а другия продължава да вегетира, намерен е само в някакъв французин. Дали може да се смята за панславянски клон или за клон на първите славянизирани все още не може да се разбере поради ниското ниво на добро тестване сред изтоноевропейците. Та дали разрастването е през ранното Средновековие или е скорощен феномен от 300-400 години ще се реши след като се обърне внимание на по-пресни стари кости и не се остава само на митохондриална хаплогрупа и автозомно изследване. Smile
https://www.yfull.com/tree/I-CTS10228/
EU-92
R-YP617*(341019,YF02433)
E-V13-BY4523(364883, YF05703)
R1a-Z93-Y15121-Y5271*(364878, YF06450)
J2a-M67-PH2758(366674, YSEQ2606)
J2a-L25-PF5350*(364879, YSEQ2347)
E-V13-FGC11450*(407620,YSEQ3598)
I2a-Y3548*(366675, YF07848)
I2a-Y3548*(414297, YF07821)
U4c1a
 
Reply
#4
Няма даже L621, която може да е на пътя на Динарците, а тя е възникнала преди 11200 години. Впрочем може и да я има в недотипираните семпъли, но те вероятно са повечето Сардинци, поне в Южна Европа. Май беше намерено нещо на пътя на M423 в Швеция.
МтДнк: Т2
 
Reply
#5
(11-09-2017, 12:39 AM)Trifud Писа: 127 нови проби (98 от Унгария, 42 от Германия и 37 от Испания) от Неолита и Халколита.

Ancient DNA studies have established that European Neolithic populations were descended from Anatolian migrants who received a limited amount of admixture from resident hunter-gatherers. Many open questions remain, however, about the spatial and temporal dynamics of population interactions and admixture during the Neolithic period. Using the highest-resolution genome-wide ancient DNA data set assembled to date --- a total of 177 samples, 127 newly reported here, from the Neolithic and Chalcolithic of Hungary (6000-2900 BCE, n = 98), Germany (5500-3000 BCE, n = 42), and Spain (5500-2200 BCE, n = 37) --- we investigate the population dynamics of Neolithization across Europe. We find that genetic diversity was shaped predominantly by local processes, with varied sources and proportions of hunter-gatherer ancestry among the three regions and through time. Admixture between groups with different ancestry profiles was pervasive and resulted in observable population transformation across almost all cultural transitions. Our results shed new light on the ways that gene flow reshaped European populations throughout the Neolithic period and demonstrate the potential of time-series-based sampling and modeling approaches to elucidate multiple dimensions of historical population interactions.

https://www.biorxiv.org/content/early/2017/11/01/114488

Enjoy!

Суровите данни още не са достъпни за да ги анализирам собственоръчно.

Супер наистина го enjoy-нах много ти благодаря, значи I2a- Sardnic, I2a-Dinaric, I2c, G2a са били страшно важни, много искам да знам за T, J2 и E-V13  и I1
EU-100
J-CTS6061
H2a2a1
 
Reply
#6
Трифуд, ти това изследване включил ли си го в твоя файл с древни проби? Според Генетикер всички R1b са V88.
Но както спомена преди, може да не споделят всички снипове на това ниво, а да разделят клона.
https://genetiker.wordpress.com/2017/11/...ic-europe/
МтДнк: Т2
 
Reply
#7
I0410 е R1b и при мен, само че моите данни са от секвенирането на този семпъл от предишните две публикации.

I1593, I1594 и I0559 не са официално публикувани още. В момента качват данните на EBI: https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/ERP104323

Предполагам, че Генетикер е ползвал данните, които Райх е извлекъл от BAM файловете: https://reich.hms.harvard.edu/datasets

Аз ще публикувам резултатите, когато обработя суровите данни, но това ще стане след като ги качат на EBI.

ПП След миграцията към hg38 ще обработя всички резултати в таблицата отново с хаплогрупи по ISOGG, YFull и коментари. Сега в таблицата ми е малко хаос - някои хаплогрупи са по дървото на Сергей, други по YFull, а трети по различни версии на ISOGG. Всичко това ще се стандартизира.
mtDNA: T2f2
Y-DNA: R1b1a1a2a2c1a1a3 (A1777/BY611/Y10789)
 
Reply
  


Свързани теми...
Теми: Автор Отговори: Преглеждания: Последно мнение
  A 12,000-year Genetic History of Rome and the Italian Peninsula genefan 1 1,285 02-21-2019, 11:44 AM
Последно мнение: dilow

Към форум: