• ¡Welcome to Square Theme!
  • This news are in header template.
  • Please ignore this message.
Здравейте гост! Вход Регистрация


Рейтинг:
  • 73 Гласа - 2.85 Средно
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
ДАНТЕ лаборатория
#81
Получих си файловете от Данте. Свалих всичките. Някой знае ли как мога да отворя ...snp.vcf файла за да видя /както на ФТДНА/ сниповете. Борих се с една програма за конвертиране dnakitstudio28 и като отворих конвертирания txt файл липсваха резултати на повече от половината от сниповете. Може и аз нещо да съм объркала, но ми се иска да поверя и сравня с фтдна.
 
Reply
#82
(04-01-2021, 08:28 AM)Радка Симеонова Писа: Получих си файловете от Данте. Свалих всичките. Някой знае ли как мога да отворя ...snp.vcf файла за да видя /както на ФТДНА/ сниповете. Борих се с една програма за конвертиране dnakitstudio28 и като отворих конвертирания txt файл липсваха резултати на повече от половината от сниповете. Може и аз нещо да съм объркала, но ми се иска да поверя и сравня с фтдна.

За работа с големи файлове са подходящи програми като Ultraedit, Glogg и др.п. Относно липсващите снипове: всички разчетени са в bam файла, пълният геном е там. VCF файловете не включват снипове, които са идентиччни с референтните, а само тези с различаващи се стойности. Успех.
 
Reply
#83
(04-01-2021, 08:40 AM)KT-YF19510 Писа:
(04-01-2021, 08:28 AM)Радка Симеонова Писа: Получих си файловете от Данте. Свалих всичките. Някой знае ли как мога да отворя ...snp.vcf файла за да видя /както на ФТДНА/ сниповете. Борих се с една програма за конвертиране dnakitstudio28 и като отворих конвертирания txt файл липсваха резултати на повече от половината от сниповете. Може и аз нещо да съм объркала, но ми се иска да поверя и сравня с фтдна.

За работа с големи файлове са подходящи програми като Ultraedit, Glogg и др.п. Относно липсващите снипове: всички разчетени са в bam файла, пълният геном е там. VCF файловете не включват снипове, които са идентиччни с референтните, а само тези с различаващи се стойности. Успех.

Благодаря Smile
 
Reply
  


Към форум: