|
Рейтинг:
ДАНТЕ лаборатория
|
(04-01-2021, 08:28 AM)Радка Симеонова Писа: Получих си файловете от Данте. Свалих всичките. Някой знае ли как мога да отворя ...snp.vcf файла за да видя /както на ФТДНА/ сниповете. Борих се с една програма за конвертиране dnakitstudio28 и като отворих конвертирания txt файл липсваха резултати на повече от половината от сниповете. Може и аз нещо да съм объркала, но ми се иска да поверя и сравня с фтдна.
(04-01-2021, 08:40 AM)KT-YF19510 Писа:(04-01-2021, 08:28 AM)Радка Симеонова Писа: Получих си файловете от Данте. Свалих всичките. Някой знае ли как мога да отворя ...snp.vcf файла за да видя /както на ФТДНА/ сниповете. Борих се с една програма за конвертиране dnakitstudio28 и като отворих конвертирания txt файл липсваха резултати на повече от половината от сниповете. Може и аз нещо да съм объркала, но ми се иска да поверя и сравня с фтдна.
За работа с големи файлове са подходящи програми като Ultraedit, Glogg и др.п. Относно липсващите снипове: всички разчетени са в bam файла, пълният геном е там. VCF файловете не включват снипове, които са идентиччни с референтните, а само тези с различаващи се стойности. Успех.
